70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1204 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  43.86 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  42.98 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  34.68 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  43.84 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  47.06 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  27.13 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  36.71 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.3 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.57 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  38.46 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  35.44 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  35.44 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  48.28 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.18 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  34.18 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  32.5 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.51 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  37.35 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.58 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.43 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.17 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.11 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.68 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  32.14 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.68 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.11 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  35.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.44 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.68 
 
 		 151 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.71 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.24 
 
 		 155 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  35.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  35.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  35.38 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  25.81 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.15 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  34.18 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0957  Tfp pilus assembly protein PilE  37.35 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  34.19 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  35.38 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  29.79 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  29.06 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  25.95 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  56.76 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  32.05 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  33.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.48 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  33.33 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  34.88 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.68 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.5 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  39.71 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  31.75 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  36.62 
 
 		 152 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>