140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1548 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  42.7 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  41.24 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  29.32 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  35.96 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  60 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  44.62 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.96 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  43.84 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  33.66 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.1 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  42.39 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.1 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  41.07 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  46.3 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.11 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  48.15 
 
 		 324 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.03 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.14 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  50 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  48.15 
 
 		 348 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.14 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.09 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  46.43 
 
 		 323 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  51.06 
 
 		 349 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.78 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  52.08 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 338 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.47 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.78 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  38.16 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  32.58 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  31.09 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  45.65 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  25 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  43.4 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  33.7 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.17 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.88 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  46.15 
 
 		 362 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  47.83 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  47.83 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  47.83 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  41.07 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  39.29 
 
 		 377 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  51.79 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  46.43 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.79 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  47.83 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.77 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  44.9 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.43 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.03 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  26.58 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  42.55 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  53.49 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.11 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.29 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.39 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  32.39 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  37.31 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  40.43 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  53.85 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  59.46 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  50 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  47.83 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  40.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  43.14 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  44.44 
 
 		 353 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  50 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.39 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  48.72 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  35.21 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  42.55 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  55.88 
 
 		 352 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  37.31 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  38.89 
 
 		 145 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  35.09 
 
 		 159 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  33.33 
 
 		 155 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  41.82 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  30.12 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  34 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>