213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0687 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  52.05 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  43.15 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  43.86 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  69.23 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  36.78 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  29.32 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  32.14 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  32.14 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  31.71 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  30.95 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  30.95 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  32.04 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  32.14 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.5 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  41.82 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.96 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  32.58 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  35.66 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  36.92 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 		 330 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  36.76 
 
 		 338 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 		 313 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  34.11 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  32.93 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  33.91 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  30.19 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  39.29 
 
 		 323 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 		 326 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  36.36 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.18 
 
 		 323 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.12 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  38.6 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.86 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  34.41 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  38.18 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  36.21 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  30.38 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.33 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.11 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.68 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  28.92 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  31.17 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  44.07 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.59 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.94 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.09 
 
 		 362 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  36.84 
 
 		 324 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  31.25 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  30.91 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  41.82 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  42.31 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.91 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  40 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  38.36 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  41.07 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  33.78 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 		 348 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.1 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  37.04 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.57 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  31.76 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.11 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  36.36 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.85 
 
 		 321 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.83 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  25.26 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0974  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  30.39 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  42.59 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.5 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  34.55 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  37.5 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  42.37 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  29.73 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  36.07 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  38.6 
 
 		 353 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  28.75 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  28.57 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  33.77 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  34.25 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.14 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  35.19 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  26.09 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  32.43 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  27.78 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>