203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1500 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  7e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  42.7 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  37.04 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.78 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  48.48 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  54.9 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  42.86 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  47.06 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  42.86 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  44.64 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  43.06 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  46.43 
 
 		 330 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  41.54 
 
 		 325 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  43.42 
 
 		 321 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  43.94 
 
 		 323 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  43.28 
 
 		 326 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  42.47 
 
 		 338 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  43.94 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 324 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.33 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  41.07 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  43.28 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  41.94 
 
 		 348 aa  48.9  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  39.39 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 		 362 aa  48.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  52.94 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  41.07 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  36.23 
 
 		 124 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  36.23 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  42.37 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  44.23 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  41.51 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.84 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  36.23 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  43.64 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  27.88 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  33.93 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  36.11 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.51 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  33.33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  42.31 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.05 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0619  hypothetical protein  43.64 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.78 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.03 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  38.24 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.33 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  43.4 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.25 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  30.95 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  47.27 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.03 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.85 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.31 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.57 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  41.38 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  32.73 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  36.36 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  43.1 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.74 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  28.07 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  27.89 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  39.29 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.61 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  33.03 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  44.83 
 
 		 219 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  32.56 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  35.53 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.38 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  40.38 
 
 		 139 aa  44.3  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  43.4 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  28.38 
 
 		 99 aa  44.3  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  43.4 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  29.49 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  42.59 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>