115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0406 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  712    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.78 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  46.77 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  50.82 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  47.69 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  43.66 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  43.08 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  42.65 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  45.9 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  44.26 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  49.12 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 		 147 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  44.07 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  45.9 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  43.55 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  32.84 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  32.84 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  32.84 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  34.38 
 
 		 151 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  36.07 
 
 		 144 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  50 
 
 		 142 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 144 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 144 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 144 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  47.83 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  34.86 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 144 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  45.1 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  29.52 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3737  type II secretion pathway protein XcpT  38.46 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.1 
 
 		 171 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 144 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 146 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 146 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.18 
 
 		 122 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 149 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  27.42 
 
 		 143 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 147 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3367  general secretion pathway protein G  35.45 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0663921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.23 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 150 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 		 150 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 		 154 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 153 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 157 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  29.58 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.54 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.7 
 
 		 167 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.7 
 
 		 157 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  32.94 
 
 		 153 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  35.59 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  27.06 
 
 		 129 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  29.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  29.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  26.47 
 
 		 146 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 142 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  27.87 
 
 		 148 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.51 
 
 		 155 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 156 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 		 149 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 159 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 169 aa  43.5  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  41.67 
 
 		 137 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  41.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  34.92 
 
 		 159 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 158 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>