152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3197 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
326 aa  681    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  70.83 
 
 
292 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.01 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  29.48 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  31.7 
 
 
323 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  28.57 
 
 
348 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  29.87 
 
 
313 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  27.83 
 
 
324 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  26.4 
 
 
323 aa  99.4  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  29.07 
 
 
331 aa  99  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  30.09 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  29.48 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  35.86 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  28.34 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  29.75 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  29.3 
 
 
259 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  32.73 
 
 
338 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  29.39 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  30.23 
 
 
359 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  31.41 
 
 
334 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  30.5 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  30.73 
 
 
319 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  27.09 
 
 
390 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  27.65 
 
 
338 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  36.36 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  27.41 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  27.98 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  34.36 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  25.93 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  25 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  31.03 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  32.63 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  45.12 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  33.17 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  26.77 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  32.5 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  28.03 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  28.44 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  28.57 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  26.69 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  25.33 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  30.46 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  31.45 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  28.7 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  29.19 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  27.83 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  26.42 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  29.84 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  48.91 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  28.78 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  30.58 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  36.2 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  37.4 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  30.24 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  29.67 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  36.84 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  36.43 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  27 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  28.06 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  31.02 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  25.07 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  32.09 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  26.77 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  25.47 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  41.05 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  40.2 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  25.09 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  37.5 
 
 
383 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  37.88 
 
 
153 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  35.71 
 
 
149 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  30.6 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  25.89 
 
 
141 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
150 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  25.4 
 
 
148 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  34.62 
 
 
138 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  25.4 
 
 
142 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  27.23 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  36.21 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  25 
 
 
135 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  48.15 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  29.52 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  25.89 
 
 
144 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  24.11 
 
 
150 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  31.25 
 
 
122 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  22.4 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  29.41 
 
 
140 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  28.38 
 
 
138 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  25.21 
 
 
144 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 
146 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 
158 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
151 aa  46.2  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  22.73 
 
 
149 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.54 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.54 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  30 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.54 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  26.47 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>