253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4221 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
346 aa  701    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  42.78 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  48.79 
 
 
361 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  51.12 
 
 
354 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  47.01 
 
 
363 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  46.36 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  45.65 
 
 
358 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  36.74 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  40.88 
 
 
366 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  35.36 
 
 
348 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  38.48 
 
 
326 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  38.64 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  38.19 
 
 
334 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  36.66 
 
 
323 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 
319 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  38.5 
 
 
332 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  39.24 
 
 
380 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  37.09 
 
 
324 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  38.86 
 
 
318 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.42 
 
 
323 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 
349 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  34.79 
 
 
325 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  42.31 
 
 
350 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  41.39 
 
 
318 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  39.51 
 
 
359 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  39.2 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  40.56 
 
 
308 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  40.41 
 
 
341 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  38.4 
 
 
336 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  35.83 
 
 
339 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  37.61 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  38.7 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  42.93 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  37.87 
 
 
352 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 
331 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  35.54 
 
 
331 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  37.31 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  37.78 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  39.02 
 
 
356 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  39.48 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  39.33 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  34.32 
 
 
327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 
333 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  39.07 
 
 
292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  39.62 
 
 
312 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  36.24 
 
 
340 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  37.2 
 
 
353 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  36.72 
 
 
337 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  36.44 
 
 
324 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  37.6 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  36.92 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  33.51 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  36.07 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  35.41 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  32.7 
 
 
309 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  35.87 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  48.65 
 
 
245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  32.63 
 
 
326 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  34.28 
 
 
366 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  32.63 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  34.71 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  33.52 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  34.41 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  33.62 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  44 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  50.69 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  27.8 
 
 
259 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  36.8 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  27.44 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  83.33 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  25.84 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  75 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  29.07 
 
 
768 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  44.62 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  51.85 
 
 
142 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 
171 aa  53.5  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  50 
 
 
142 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  32.65 
 
 
153 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  31.06 
 
 
158 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  32.26 
 
 
137 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  48.33 
 
 
131 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  29.82 
 
 
742 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 
124 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
141 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  48.15 
 
 
173 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.05 
 
 
138 aa  50.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3830  hypothetical protein  31.63 
 
 
368 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  35.56 
 
 
129 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  38.98 
 
 
219 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
150 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  37.93 
 
 
152 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  48.15 
 
 
155 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
150 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>