More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0161 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
361 aa  740    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  80.22 
 
 
363 aa  560  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  68.21 
 
 
362 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  56.83 
 
 
358 aa  338  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  43.8 
 
 
362 aa  259  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  50.4 
 
 
354 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  48.65 
 
 
346 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  42.13 
 
 
366 aa  186  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  40.96 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  38.86 
 
 
326 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 
334 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  38.73 
 
 
319 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  39.03 
 
 
328 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  36.17 
 
 
321 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  35.66 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.44 
 
 
323 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  36.09 
 
 
348 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  35.11 
 
 
324 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  40.23 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  38.39 
 
 
323 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  37.24 
 
 
308 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  38.48 
 
 
356 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  39.13 
 
 
338 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  39.6 
 
 
341 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  36.6 
 
 
380 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  40.37 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  37.86 
 
 
318 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  33.42 
 
 
325 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  36.39 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  33.79 
 
 
349 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  37.3 
 
 
336 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  38.52 
 
 
350 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  36.55 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  38.53 
 
 
333 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  35.48 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  39.66 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  34.43 
 
 
337 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  36.8 
 
 
339 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  38.87 
 
 
367 aa  123  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  34.76 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  36.96 
 
 
318 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  33.85 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  34.76 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  35.63 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  36.09 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  35.34 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  33.76 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  35.83 
 
 
340 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  36.39 
 
 
314 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  30.88 
 
 
309 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  54.05 
 
 
361 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  33.51 
 
 
327 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  42.17 
 
 
332 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  43.69 
 
 
292 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  53.64 
 
 
345 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  40.97 
 
 
324 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  49.5 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  28.78 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  34.16 
 
 
390 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  39.49 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  50 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  28.3 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  30.35 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  52.08 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  81.67 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  40 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  28.44 
 
 
259 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  59.26 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  54.55 
 
 
142 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  52.73 
 
 
142 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.96 
 
 
154 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  43.1 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  48.28 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.68 
 
 
150 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.68 
 
 
150 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.68 
 
 
150 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 
158 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.68 
 
 
150 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  34.74 
 
 
154 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  30.83 
 
 
129 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  25.46 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  30.61 
 
 
149 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  23.42 
 
 
333 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  41.54 
 
 
129 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  32 
 
 
142 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  49.09 
 
 
173 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  38.55 
 
 
124 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  37.35 
 
 
128 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  37.18 
 
 
124 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.93 
 
 
148 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  50.91 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  28.65 
 
 
768 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  37.35 
 
 
124 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  31.18 
 
 
155 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>