223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2092 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
327 aa  677    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  36.95 
 
 
313 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  40.06 
 
 
326 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.53 
 
 
321 aa  166  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  37.22 
 
 
323 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  36.53 
 
 
323 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  36.2 
 
 
324 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  35.58 
 
 
325 aa  152  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  40.43 
 
 
331 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  37.31 
 
 
292 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.51 
 
 
362 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  33.14 
 
 
348 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  37.28 
 
 
349 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  38.87 
 
 
312 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  34.52 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  33.89 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  38.2 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  38.21 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  37.79 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  35.31 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  34.82 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  37.94 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  36.53 
 
 
318 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  33.53 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  36.29 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  37.71 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  36.34 
 
 
336 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  36.27 
 
 
352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  37.35 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  34.32 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  30.72 
 
 
353 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  35.69 
 
 
309 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  34.11 
 
 
319 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  35.97 
 
 
361 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 
386 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  35.06 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  35.18 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  35.1 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  37.61 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  36.64 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  35.45 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  35.03 
 
 
349 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  33.61 
 
 
366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  35.49 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  29.75 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  36.13 
 
 
380 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  42.27 
 
 
366 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  33.89 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  36.7 
 
 
314 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  41.86 
 
 
245 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  34.83 
 
 
336 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  33.51 
 
 
361 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  34.01 
 
 
333 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  35.59 
 
 
345 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  33.84 
 
 
325 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  29.1 
 
 
259 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  41.88 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  33.89 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  41.56 
 
 
367 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  31.7 
 
 
390 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  30.35 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  39.22 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  29.02 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  62.75 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  36.86 
 
 
369 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  29.53 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  39.82 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  30.17 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  52.75 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  25.09 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  39 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  33.03 
 
 
768 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  32.37 
 
 
742 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  73.21 
 
 
431 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  37 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  36 
 
 
142 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  27.65 
 
 
165 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3933  hypothetical protein  33.64 
 
 
217 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3830  hypothetical protein  38.55 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  37.04 
 
 
188 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
175 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  38.33 
 
 
219 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  49.15 
 
 
352 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
141 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.19 
 
 
158 aa  49.3  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.55 
 
 
159 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  43.4 
 
 
129 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  38.57 
 
 
134 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  31.25 
 
 
135 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  30 
 
 
99 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  40.85 
 
 
172 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  31.34 
 
 
169 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  38.03 
 
 
162 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  33.71 
 
 
152 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.56 
 
 
156 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 
160 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  31.62 
 
 
173 aa  46.6  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.61 
 
 
169 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.27 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>