299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0072 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
318 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  39.17 
 
 
313 aa  185  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  42.81 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  37.64 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.07 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  40.37 
 
 
326 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  37.32 
 
 
325 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  43.73 
 
 
331 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  41.91 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  37.92 
 
 
349 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  35.53 
 
 
324 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.05 
 
 
321 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.47 
 
 
323 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  41.21 
 
 
318 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  40.12 
 
 
336 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 
362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  39.11 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  32.97 
 
 
338 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  41.59 
 
 
346 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  39.14 
 
 
334 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  40.06 
 
 
345 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  34.31 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  33.52 
 
 
353 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  39.35 
 
 
309 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  38.3 
 
 
331 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  38.24 
 
 
319 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  37.61 
 
 
328 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  38.61 
 
 
339 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  40.43 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  37.86 
 
 
361 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  36.04 
 
 
366 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  37.46 
 
 
340 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  37.84 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  38.78 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  37.95 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  34.08 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  35.28 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  36.68 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  36.36 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  40.12 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  36.03 
 
 
362 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  35.28 
 
 
350 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  35.54 
 
 
359 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  34.65 
 
 
363 aa  122  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  37.43 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  36.36 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  38.37 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  37.09 
 
 
327 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  46.23 
 
 
356 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  35.47 
 
 
349 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  35.06 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  33.69 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  35.96 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  36.06 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  52.43 
 
 
245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  35.87 
 
 
324 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  43.75 
 
 
367 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  27.59 
 
 
326 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  41.44 
 
 
351 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  49.52 
 
 
338 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  31.4 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  28.44 
 
 
292 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  51.81 
 
 
383 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  40.95 
 
 
390 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  26.6 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  29.47 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  80.33 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  27.14 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  23.34 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  36.91 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  75.44 
 
 
431 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  44.59 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  33.33 
 
 
742 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  28.41 
 
 
768 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
141 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 
171 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  36.51 
 
 
134 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39.47 
 
 
142 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  35.38 
 
 
122 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.47 
 
 
142 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.57 
 
 
154 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
150 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  48.15 
 
 
173 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 
158 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 
124 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
142 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  39.68 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  36.11 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  43.1 
 
 
129 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>