293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1619 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
361 aa  742    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  48.92 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  46.76 
 
 
345 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  40.87 
 
 
366 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  39.62 
 
 
333 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.51 
 
 
323 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  33.95 
 
 
321 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  35.05 
 
 
313 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  34.07 
 
 
323 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  34.62 
 
 
326 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  34.57 
 
 
325 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  37.43 
 
 
341 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  34.03 
 
 
348 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  37.13 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  35.87 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  37.77 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  34.99 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  36.15 
 
 
332 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  53.68 
 
 
362 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  34.67 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  35.14 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  32.37 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  33.42 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  35.92 
 
 
352 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  34.6 
 
 
334 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  35.97 
 
 
327 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  35 
 
 
331 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  37.57 
 
 
336 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  31.56 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  33.87 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  47.59 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  36.92 
 
 
346 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  35.31 
 
 
318 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  29.56 
 
 
338 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  58.1 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  33.42 
 
 
359 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  32.85 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  36.19 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  36.78 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  33.61 
 
 
337 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  35.45 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  34.13 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  34.6 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  32.83 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  30.08 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  34.99 
 
 
339 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  54.05 
 
 
361 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  32.65 
 
 
309 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  34.4 
 
 
314 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 
245 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  33.77 
 
 
380 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  31.58 
 
 
367 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  31.53 
 
 
390 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  59.29 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  63.21 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  32.64 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  28.01 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  66 
 
 
292 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  25.07 
 
 
326 aa  89.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  56.48 
 
 
333 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  61.62 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  34.97 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  50.46 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  87.04 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  46.91 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  35.25 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  35.48 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  49.23 
 
 
142 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  47.69 
 
 
142 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  67.24 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
129 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
128 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  45.9 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
124 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
124 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  41.1 
 
 
219 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
124 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  43.08 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  39.06 
 
 
124 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  40.62 
 
 
124 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  34.94 
 
 
173 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  36.49 
 
 
140 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 
768 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  31.2 
 
 
742 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
159 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  42.62 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.67 
 
 
157 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
154 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
163 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.21 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  39.66 
 
 
138 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
171 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
154 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  44.44 
 
 
131 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>