More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3724 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
333 aa  689    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  43.25 
 
 
331 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  37.77 
 
 
349 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  36.6 
 
 
348 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  40.42 
 
 
326 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  42.81 
 
 
318 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.22 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  37.07 
 
 
313 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  41.34 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  39.66 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  39.57 
 
 
352 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  35.07 
 
 
325 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  39.62 
 
 
361 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.69 
 
 
321 aa  159  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  38.11 
 
 
323 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.03 
 
 
362 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  39.11 
 
 
356 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  37.22 
 
 
324 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  39.6 
 
 
341 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  38.4 
 
 
366 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  40.05 
 
 
339 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  39.72 
 
 
308 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  37.14 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  33.99 
 
 
338 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  37.6 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  33.72 
 
 
331 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  38.57 
 
 
328 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  33.62 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  40.21 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  35.47 
 
 
369 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  37.22 
 
 
334 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  39.83 
 
 
362 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  39.72 
 
 
358 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  38.2 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  38.94 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  35.33 
 
 
390 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  33.03 
 
 
309 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  37.17 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  37.35 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  31.52 
 
 
353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  38.21 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  37.71 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  35.35 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  37.39 
 
 
319 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  36.01 
 
 
340 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  36.51 
 
 
349 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  36.64 
 
 
314 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  35.5 
 
 
380 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  35.14 
 
 
354 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  36.48 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  37.57 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  43.59 
 
 
245 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  33.24 
 
 
333 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  35.11 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  36.58 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  37.06 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  34.73 
 
 
318 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 
325 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  34.03 
 
 
351 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  34.83 
 
 
324 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  25 
 
 
326 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  29.89 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  27.23 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  27.08 
 
 
292 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  26.71 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  48.28 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  84.21 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  25.81 
 
 
259 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  29.26 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  36.46 
 
 
742 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  73.21 
 
 
431 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  30.25 
 
 
317 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  47.54 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  38.67 
 
 
768 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  48.39 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.39 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 
165 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  28.36 
 
 
160 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.77 
 
 
158 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.12 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  32.94 
 
 
155 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  31.18 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  44.26 
 
 
129 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  33.68 
 
 
152 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 
150 aa  53.5  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  31.91 
 
 
149 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  31.91 
 
 
149 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
159 aa  53.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 
150 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 
150 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  42.37 
 
 
129 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.98 
 
 
163 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>