194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2888 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  882    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  54.02 
 
 		 326 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  41.04 
 
 		 330 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  70.69 
 
 		 313 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  59.72 
 
 		 325 aa  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  55.29 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  70.91 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  69.64 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  70.37 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  67.24 
 
 		 338 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  69.35 
 
 		 348 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  69.09 
 
 		 362 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  72.73 
 
 		 324 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  68.52 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  60.71 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  61.82 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  46.97 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  56.25 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  48.15 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  63.79 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  68.75 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  56.25 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  76.79 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  73.68 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  75.44 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  67.74 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  71.93 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  75 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  70 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  74.55 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  56.98 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  74.55 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  65.62 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  74.55 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  74.55 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  69.49 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  74.55 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  58.06 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  73.21 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  74.55 
 
 		 361 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  72.41 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  70.69 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  73.21 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  63.08 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  65.08 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  66.67 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  72.73 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  67.19 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  65.62 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  77.36 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  73.21 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  67.19 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  72.73 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  68.97 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  72.73 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  74.07 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  70.91 
 
 		 308 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  63.38 
 
 		 292 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  67.24 
 
 		 361 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  39.73 
 
 		 259 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  73.21 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  67.86 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  52.27 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  72.73 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  50.59 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  35.62 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.94 
 
 		 142 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  49.12 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  46.27 
 
 		 179 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  44.07 
 
 		 142 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  67.86 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  37.76 
 
 		 227 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 		 129 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  47.17 
 
 		 155 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  43.94 
 
 		 163 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3594  hypothetical protein  47.17 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  52.63 
 
 		 162 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 		 155 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  63.16 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  38.6 
 
 		 153 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.06 
 
 		 151 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 		 154 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50 
 
 		 165 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 		 155 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  41.51 
 
 		 252 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 		 171 aa  47  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  31.58 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  25.93 
 
 		 138 aa  47  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.98 
 
 		 168 aa  47  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  37.7 
 
 		 129 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 156 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  45.28 
 
 		 171 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  33.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  37.29 
 
 		 145 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  38.46 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  46.67 
 
 		 174 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  44.19 
 
 		 154 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>