106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0863 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  100 
 
 		 395 aa  813    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0865  hypothetical protein  44.3 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.220364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  25.6 
 
 		 319 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  32.09 
 
 		 152 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  30.1 
 
 		 145 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  30.09 
 
 		 145 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 		 150 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  29.85 
 
 		 184 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  33.82 
 
 		 152 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  30.48 
 
 		 150 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.56 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32 
 
 		 140 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.56 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  27.56 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  30.99 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.56 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.56 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  30.37 
 
 		 153 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  27.56 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  27.52 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  32.98 
 
 		 163 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  34.72 
 
 		 163 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  28.42 
 
 		 172 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.82 
 
 		 145 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 158 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 124 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  31.33 
 
 		 133 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 174 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 186 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.32 
 
 		 158 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  30.95 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  31.58 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 182 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  30.88 
 
 		 130 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 154 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  33.9 
 
 		 166 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  33.82 
 
 		 122 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  34.85 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  28.97 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 		 163 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 155 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  27.84 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  33.82 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  36.23 
 
 		 159 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  28.57 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  28.32 
 
 		 143 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 155 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  29.63 
 
 		 182 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 159 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  29.07 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  34.48 
 
 		 137 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  23.81 
 
 		 153 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 159 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  32.84 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  35.71 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  28.21 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 131 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  30.88 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  32.84 
 
 		 138 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  35.38 
 
 		 163 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  36.67 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  27.38 
 
 		 193 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.79 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 148 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  31.34 
 
 		 186 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  31.75 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  31.15 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  35.71 
 
 		 169 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  35.71 
 
 		 169 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  35.71 
 
 		 169 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 156 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  32.86 
 
 		 122 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  29.85 
 
 		 124 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 167 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  30.67 
 
 		 201 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 175 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  30.3 
 
 		 145 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  30.91 
 
 		 144 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  30.14 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  32.39 
 
 		 147 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  33.9 
 
 		 173 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>