121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0865 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  770    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.220364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  44.3 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  28.43 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  30.83 
 
 		 159 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 150 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.77 
 
 		 150 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  27.12 
 
 		 149 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.82 
 
 		 129 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 142 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  31.94 
 
 		 129 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  48.72 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  31.52 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  41.54 
 
 		 114 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 		 147 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  30.69 
 
 		 144 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  27.05 
 
 		 172 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  36.84 
 
 		 121 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  27.27 
 
 		 140 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  26.56 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  30.12 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  29.85 
 
 		 184 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  30.69 
 
 		 144 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 166 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  30.69 
 
 		 151 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  25.64 
 
 		 135 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  46.34 
 
 		 147 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  51.35 
 
 		 173 aa  46.2  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  29.17 
 
 		 124 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  28 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  33.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  34.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  36.51 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  25.35 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  30.85 
 
 		 122 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 		 146 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  30.85 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  27.4 
 
 		 153 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  25.47 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  34.18 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  33.82 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  48.65 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  30.14 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  48.65 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  55.88 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  48.65 
 
 		 186 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  52.78 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  47.37 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  46.67 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 154 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 		 145 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  27.27 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  48.65 
 
 		 171 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  43.9 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  30.56 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 		 165 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0615  hypothetical protein  29.89 
 
 		 144 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 145 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.56 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  48.65 
 
 		 182 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  31.11 
 
 		 166 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  60 
 
 		 144 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  31.43 
 
 		 122 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  25.97 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  58.33 
 
 		 144 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  32.91 
 
 		 129 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 155 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  25.27 
 
 		 150 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  25.27 
 
 		 150 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  23.88 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  58.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  25.27 
 
 		 150 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  32.81 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  42.5 
 
 		 179 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 138 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  31.67 
 
 		 187 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  45.95 
 
 		 169 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  45.95 
 
 		 169 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  39.13 
 
 		 192 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  45.95 
 
 		 169 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 		 154 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  32.35 
 
 		 145 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  28.36 
 
 		 191 aa  43.5  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  40.43 
 
 		 218 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  58.06 
 
 		 150 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  27.5 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  48.78 
 
 		 701 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 164 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  41.46 
 
 		 201 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  32.56 
 
 		 182 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>