227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2240 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  231  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2094  hypothetical protein  44.07 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.548773  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  41.9 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  46.48 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  41.57 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  46.03 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  48.33 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  44.44 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  36.36 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  32.89 
 
 
319 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.61 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  36.05 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  58.97 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  31.54 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2464  hypothetical protein  56.25 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  39.13 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  45.45 
 
 
138 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  40.48 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  50 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  45.45 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  43.75 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  45.45 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  45.28 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  29.91 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  44.23 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  45.28 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  50 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  41.3 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  50 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  47.73 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  51.16 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2463  hypothetical protein  53.03 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  38.75 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  39.53 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  54.05 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  51.35 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  29.49 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  40.98 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  37.35 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  48.72 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  37.21 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0865  hypothetical protein  44.44 
 
 
374 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.220364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  51.11 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  34.69 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  39.22 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  50 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  50 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  48.84 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  47.92 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  44.68 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  36.49 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  30.93 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  43.86 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  48.65 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  50 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  48.57 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  44.68 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  52.27 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  46.51 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  29.51 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  53.33 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  51.35 
 
 
142 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  52.63 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  52.78 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  53.33 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  35.85 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.83 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  48.78 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  48.72 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  44.23 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  52.38 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  47.5 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  52.38 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  50 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  57.58 
 
 
170 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  46.67 
 
 
138 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  33.96 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>