157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2670 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0865  hypothetical protein  28.43 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.220364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  25.6 
 
 
395 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  34.09 
 
 
153 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  38.55 
 
 
150 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 
146 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  37.88 
 
 
139 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  32.89 
 
 
123 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 
147 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 
166 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 
147 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  29.73 
 
 
152 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  38.1 
 
 
143 aa  52.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  37.93 
 
 
144 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  35.05 
 
 
159 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 
139 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
145 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.27 
 
 
121 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  37.7 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  43.75 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  37.7 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  40.48 
 
 
202 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  40.32 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 
172 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  34.15 
 
 
158 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  36.76 
 
 
137 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  31.65 
 
 
186 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  30.12 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  32.17 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  36.92 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  32.17 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  34.35 
 
 
205 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  32.17 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  32.17 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  40.98 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  46.94 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.91 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  46.94 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  27.91 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  27.91 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  46.94 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 
160 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  35.71 
 
 
173 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  32.93 
 
 
221 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  33.33 
 
 
121 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 
150 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  47.92 
 
 
205 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  45.1 
 
 
179 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  46.94 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.73 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 
150 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 
150 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  32.73 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  47.92 
 
 
205 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  40 
 
 
145 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  29.41 
 
 
195 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  46.81 
 
 
218 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  36.07 
 
 
150 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  38.1 
 
 
163 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  51.22 
 
 
151 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  31.07 
 
 
138 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  35 
 
 
163 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  34.69 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  44.23 
 
 
219 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 
154 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
150 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35.9 
 
 
129 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  29.29 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
164 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  30.43 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  38.03 
 
 
131 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  24.85 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  32.73 
 
 
144 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  46.34 
 
 
158 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  28.74 
 
 
114 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  33.33 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  33.33 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  43.75 
 
 
159 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
147 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  33.71 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  40.82 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>