More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1170 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  100 
 
 
129 aa  263  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  36.26 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  37.36 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  36.26 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  36.26 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  42.62 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  41.94 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  45.71 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  35.37 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  30.58 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  27.27 
 
 
184 aa  63.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  39.34 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.03 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  33.82 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.66 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  44.44 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  35.37 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  40.62 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  40.62 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  34.88 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  34.88 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  37.5 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  45.76 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  38.33 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  40.62 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  35.96 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  37 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  32.93 
 
 
149 aa  57  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.91 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  30.28 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  39.44 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.51 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  37.7 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  38.46 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  32 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  37.7 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  29.27 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  37.1 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  42.86 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  35.21 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  42.86 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  46.03 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.4 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  31.4 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  40.68 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  46.67 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  38.1 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  51.72 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  33.33 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.33 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.89 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.62 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  34.18 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  31.76 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  36.51 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  30.68 
 
 
209 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  34.85 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  36.99 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.71 
 
 
167 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  49.06 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 
175 aa  53.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  30.12 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.7 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  40.32 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  38.98 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  32.97 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>