33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0866 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1414    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2669  hypothetical protein  28.86 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 148 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 		 144 aa  48.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  53.49 
 
 		 144 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 152 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 		 163 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  37.88 
 
 		 149 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  37.29 
 
 		 145 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 149 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 		 144 aa  45.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  51.22 
 
 		 150 aa  45.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  46.94 
 
 		 151 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  40.82 
 
 		 148 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 193 aa  45.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  47.62 
 
 		 144 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 159 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 		 156 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  39.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 		 155 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  38.18 
 
 		 144 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 154 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  56.25 
 
 		 139 aa  44.3  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 154 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 		 158 aa  43.9  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>