294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2678 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
349 aa  724    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  49.19 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  47.51 
 
 
345 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  42.93 
 
 
366 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  38.38 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  37.22 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  36.03 
 
 
321 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  35.92 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  35.88 
 
 
313 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  37.23 
 
 
333 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  37.33 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  35.03 
 
 
326 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  36.54 
 
 
331 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  34.96 
 
 
362 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  35.91 
 
 
341 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  33.88 
 
 
330 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  34.49 
 
 
348 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  32.32 
 
 
338 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  31.65 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  34.04 
 
 
353 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  37.85 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  35.85 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  34.28 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  35.49 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  31.45 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  34.02 
 
 
352 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  38.14 
 
 
336 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  33.62 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  36.71 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  33.86 
 
 
334 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 
346 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  36.21 
 
 
319 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  35.09 
 
 
340 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  35.39 
 
 
339 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  37.36 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  33.85 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  33.94 
 
 
356 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  35.43 
 
 
318 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  35.19 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  35.62 
 
 
363 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  35.59 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  34.72 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  33.88 
 
 
332 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  33.77 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  35.13 
 
 
292 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  32.65 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  34.32 
 
 
349 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  33.07 
 
 
390 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  28.65 
 
 
292 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  34.08 
 
 
358 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  34.06 
 
 
361 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  31.3 
 
 
380 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  34.06 
 
 
328 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  31.96 
 
 
314 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  34.4 
 
 
362 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  27.03 
 
 
326 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  33.24 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  35.44 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  31.61 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  31.75 
 
 
350 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  41.96 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  28.95 
 
 
377 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  39.56 
 
 
351 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  27.38 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  55.14 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  85.96 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  65.91 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  36.08 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  70.37 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  47.69 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  46.15 
 
 
142 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  44.62 
 
 
142 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  44.26 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  31.44 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.77 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.77 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.77 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  38.89 
 
 
124 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  40.79 
 
 
768 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  37.5 
 
 
128 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  37.5 
 
 
124 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  40.91 
 
 
129 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  33.8 
 
 
161 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  31.17 
 
 
150 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  36.11 
 
 
124 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  31.17 
 
 
150 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  34.72 
 
 
124 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  31.17 
 
 
150 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  31.08 
 
 
155 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  52.08 
 
 
227 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
154 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  31.17 
 
 
150 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
154 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  39.68 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.68 
 
 
159 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31.17 
 
 
158 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  39.34 
 
 
219 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  34.18 
 
 
99 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  28.75 
 
 
169 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>