143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0027 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
331 aa  684    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  40.12 
 
 
323 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  36.81 
 
 
330 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  36.34 
 
 
313 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.92 
 
 
321 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  34.25 
 
 
348 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  35.95 
 
 
323 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  34.4 
 
 
324 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  34.36 
 
 
326 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  34.37 
 
 
386 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  31.65 
 
 
349 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  37.87 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  34.75 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  35.47 
 
 
325 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  35.75 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  37 
 
 
308 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  34.79 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  35.22 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  33.51 
 
 
356 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  37.96 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  35.28 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  34.92 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  37.32 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  34.17 
 
 
333 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  31.67 
 
 
338 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  33.72 
 
 
333 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  28.46 
 
 
353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  34.38 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  33.24 
 
 
328 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  34.63 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  36.45 
 
 
336 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  33.03 
 
 
312 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  33.51 
 
 
341 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  35.84 
 
 
346 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  34.28 
 
 
349 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 
362 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  31.71 
 
 
314 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  40.8 
 
 
245 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  34.25 
 
 
292 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  30.68 
 
 
340 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  34.08 
 
 
318 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  33.73 
 
 
327 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  30.84 
 
 
309 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  33.24 
 
 
380 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  32.82 
 
 
319 aa  99  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  31.4 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  31.48 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  32.13 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  32.24 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  34.11 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  33.99 
 
 
345 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  32.13 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  41.59 
 
 
351 aa  92.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  27.74 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  31.56 
 
 
361 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  38.14 
 
 
390 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  31.37 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  31.14 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  31.68 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  34.12 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  27.37 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  28.87 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  26.6 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  25.33 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  55.88 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  42.7 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  31.08 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  36.46 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  67.74 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  55.29 
 
 
431 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  24.23 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  29.91 
 
 
169 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3737  type II secretion pathway protein XcpT  41.67 
 
 
212 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  28.18 
 
 
768 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  47.83 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  30.88 
 
 
137 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  28.7 
 
 
163 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
141 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  30.26 
 
 
153 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  30.77 
 
 
153 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 
147 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
142 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.85 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.29 
 
 
163 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
148 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  28.57 
 
 
395 aa  45.8  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  34.92 
 
 
333 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  32.43 
 
 
131 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  41.07 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.25 
 
 
122 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.41 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  37.88 
 
 
172 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  31.58 
 
 
152 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  26.21 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3830  hypothetical protein  32.43 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.14 
 
 
159 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>