220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2813 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
339 aa  691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  63.11 
 
 
348 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  40.18 
 
 
325 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  37.54 
 
 
313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  39.09 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  40.58 
 
 
331 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  39.18 
 
 
323 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  43.24 
 
 
318 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  41.53 
 
 
328 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  36.69 
 
 
324 aa  169  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  41.76 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  38.48 
 
 
326 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  41.41 
 
 
341 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  39.02 
 
 
333 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.81 
 
 
362 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  40.59 
 
 
319 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  38.04 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  40.33 
 
 
333 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.41 
 
 
323 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  32.96 
 
 
330 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  38.15 
 
 
312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  34.4 
 
 
349 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  36.93 
 
 
350 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  38.04 
 
 
359 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  38.89 
 
 
318 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  39.45 
 
 
337 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  37.84 
 
 
366 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  35.83 
 
 
346 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  34.38 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  38.28 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  39.52 
 
 
352 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  31.86 
 
 
338 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  36.31 
 
 
309 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  38.38 
 
 
380 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  37.11 
 
 
356 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  37.71 
 
 
327 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  34.18 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  36.61 
 
 
336 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  36.51 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  35.62 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  36.26 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  32.97 
 
 
353 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  33.92 
 
 
386 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  36.8 
 
 
361 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  34.33 
 
 
363 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  38.55 
 
 
331 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  37.94 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  35.95 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  37.03 
 
 
358 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  35.73 
 
 
314 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  35.51 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  37.07 
 
 
345 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  35.94 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  35.17 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  33.16 
 
 
390 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  33.93 
 
 
325 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  34.99 
 
 
361 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  33.99 
 
 
349 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  38.13 
 
 
245 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  32.07 
 
 
338 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  28.03 
 
 
326 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  30.03 
 
 
377 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  40.81 
 
 
367 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  48.73 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  27.33 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  41.67 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  25.24 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  39.81 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  76.56 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  25.86 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  24.27 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  73.21 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  46.15 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  31.25 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.77 
 
 
142 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.64 
 
 
142 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.94 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  35.38 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3830  hypothetical protein  60 
 
 
368 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 
159 aa  50.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 
167 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
150 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.98 
 
 
157 aa  49.7  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  39.71 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
141 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  47.17 
 
 
158 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  50 
 
 
227 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.15 
 
 
154 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  38.98 
 
 
252 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  41.67 
 
 
124 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.3 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  25.1 
 
 
768 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  37.7 
 
 
129 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 
129 aa  47.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>