111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0394 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  49.09 
 
 
377 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  40.3 
 
 
323 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  37.21 
 
 
130 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.18 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  43.86 
 
 
338 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  40.91 
 
 
349 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  31.13 
 
 
146 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.21 
 
 
122 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  28.23 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  42.59 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  27.34 
 
 
128 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  35.38 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  39.68 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  39.68 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 
166 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  38.46 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  38.46 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.92 
 
 
146 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  38.78 
 
 
160 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.09 
 
 
168 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  44.23 
 
 
152 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.67 
 
 
126 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.64 
 
 
176 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  31.58 
 
 
353 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  33.93 
 
 
147 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  41.18 
 
 
145 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
147 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.48 
 
 
174 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.84 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  36.62 
 
 
155 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  51.52 
 
 
152 aa  45.4  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  40.32 
 
 
161 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.59 
 
 
362 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  40.74 
 
 
313 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  40.62 
 
 
133 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  38.89 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  24.14 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.75 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  36.36 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.58 
 
 
129 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  39.06 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  47.83 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  38.89 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  34.12 
 
 
129 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  31.91 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  32.84 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.46 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.5 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  32.5 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  36.51 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  34.15 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  36.36 
 
 
132 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  36.73 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  30.23 
 
 
128 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.88 
 
 
167 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.83 
 
 
161 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  46.67 
 
 
186 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  46.67 
 
 
186 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  43.48 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0809  hypothetical protein  34.92 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0064  hypothetical protein  38.1 
 
 
457 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  36.84 
 
 
162 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  35.85 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  35.48 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  35.48 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  38.89 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  30.23 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.83 
 
 
159 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 
147 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  34.12 
 
 
167 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
158 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
149 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  45.45 
 
 
166 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 
146 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  34.55 
 
 
165 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  51.22 
 
 
178 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  63.33 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 
157 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  41.82 
 
 
135 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
160 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 
144 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  25.58 
 
 
130 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  37.04 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  33.85 
 
 
124 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  36.92 
 
 
144 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  35.21 
 
 
142 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  28.57 
 
 
126 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
124 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  36.49 
 
 
161 aa  42.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>