More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3726 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
308 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  49.7 
 
 
328 aa  236  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  46.63 
 
 
319 aa  218  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  40.3 
 
 
313 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  39.73 
 
 
362 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  44.64 
 
 
333 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  36.28 
 
 
321 aa  185  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  40.12 
 
 
348 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  41.09 
 
 
323 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  41.48 
 
 
352 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  37.04 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  43.22 
 
 
312 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  42.4 
 
 
334 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  40.78 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  41.67 
 
 
318 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  41.76 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  36.92 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  41.52 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 
326 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  38.97 
 
 
323 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  39.05 
 
 
324 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  39.72 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  37 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  40.59 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  38.89 
 
 
341 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  37.65 
 
 
331 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  41.19 
 
 
292 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  36.65 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  38.69 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  35.06 
 
 
330 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 
361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  40.56 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  37.11 
 
 
363 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  39.89 
 
 
354 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  34.38 
 
 
338 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  40.81 
 
 
349 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  40.43 
 
 
318 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  36.81 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  36.97 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  37.63 
 
 
358 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  38.26 
 
 
337 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  37.5 
 
 
345 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  37.17 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  36.69 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  35.28 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  38.8 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  41.42 
 
 
336 aa  138  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  38.21 
 
 
327 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  39.6 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  38.97 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  38.61 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  35.87 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  35.79 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  35.68 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  36.84 
 
 
369 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  31.04 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  35.65 
 
 
325 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  43.06 
 
 
367 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  45.9 
 
 
245 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  29.11 
 
 
377 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  28.86 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  29.18 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  28.87 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  29.47 
 
 
292 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  30.51 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  41.21 
 
 
390 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  81.36 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  32.24 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  65.22 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  23.21 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  40 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  70.91 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  27.42 
 
 
768 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  51.85 
 
 
142 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  30.48 
 
 
129 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  50 
 
 
142 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  35.79 
 
 
124 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  56.52 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  43.04 
 
 
129 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.89 
 
 
138 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  39.13 
 
 
161 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.32 
 
 
140 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 
150 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 
150 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 
150 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  33.68 
 
 
128 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.47 
 
 
168 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
171 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
141 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  43.59 
 
 
173 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  33.68 
 
 
124 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.62 
 
 
163 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
154 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
158 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>