More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4238 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
350 aa  710    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  56.99 
 
 
367 aa  338  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  41.27 
 
 
359 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  36.27 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  42.23 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  38.69 
 
 
323 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  38.66 
 
 
326 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  35.51 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  41.24 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  36.9 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  37.92 
 
 
349 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  35.19 
 
 
324 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  34.84 
 
 
330 aa  159  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  34.89 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  37.3 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  34.79 
 
 
331 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  42.31 
 
 
346 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  39.3 
 
 
334 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.92 
 
 
362 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  38.8 
 
 
308 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  38.75 
 
 
352 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  35.49 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  36.68 
 
 
339 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  36.95 
 
 
356 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  36.7 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  37.74 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  37.77 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  40.32 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  38.36 
 
 
361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  34.95 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  38.13 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  37.86 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  39.29 
 
 
338 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  37.6 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  37.17 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  34.98 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  36.29 
 
 
390 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  34.66 
 
 
333 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  47.25 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  36.93 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  33 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  35.89 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  43.98 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  36.01 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  44.5 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  30.95 
 
 
318 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  35.86 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  32.61 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  43.44 
 
 
312 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  50.37 
 
 
349 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  35.52 
 
 
318 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  35.94 
 
 
369 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  35.07 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  45.75 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  32.45 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  41.08 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  42.6 
 
 
358 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  38.57 
 
 
325 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  35.13 
 
 
314 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  47.96 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  28.7 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  53.52 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  33.19 
 
 
338 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  36.04 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  30.12 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  31.35 
 
 
259 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  65.96 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  88.24 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  36.24 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  29.65 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  44.44 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  69.49 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0745  protein of unknown function DUF1559  24.62 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  47.54 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.28 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  48.21 
 
 
142 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  36.25 
 
 
129 aa  52.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  40 
 
 
141 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  27.37 
 
 
173 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
154 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.38 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
150 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
171 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
154 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
142 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 
144 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  34.02 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  39.34 
 
 
219 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  35.23 
 
 
165 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
126 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  46.43 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
148 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>