278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0876 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
386 aa  775    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  40.57 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  36.41 
 
 
348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  35.26 
 
 
313 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  34.91 
 
 
331 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  34.9 
 
 
330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.26 
 
 
321 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  36.52 
 
 
356 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  36.41 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  36.75 
 
 
308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  35.19 
 
 
349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  34.89 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  42.8 
 
 
338 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.68 
 
 
362 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  37 
 
 
350 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  36.59 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  35.75 
 
 
318 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  36.82 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  35.5 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  35.25 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  36.62 
 
 
341 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  33.92 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  37.64 
 
 
353 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  36.46 
 
 
336 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  35.19 
 
 
327 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  35.64 
 
 
337 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  36.88 
 
 
359 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  36 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  34.71 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  35.32 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  33.67 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  33.67 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  38.43 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  33.58 
 
 
354 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  34.16 
 
 
331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  34.76 
 
 
361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  36.59 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  42.64 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  35.7 
 
 
331 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  33.25 
 
 
318 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  43.48 
 
 
292 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  34.69 
 
 
369 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  30.9 
 
 
333 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  34.44 
 
 
336 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  31.82 
 
 
363 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  52.86 
 
 
351 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  31.96 
 
 
309 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  54.55 
 
 
334 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  40.12 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  54.89 
 
 
319 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  54.48 
 
 
312 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  53.42 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  41.01 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  51.88 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  50.69 
 
 
346 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  36.43 
 
 
326 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  44.44 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  42.06 
 
 
377 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  50.68 
 
 
328 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  39.33 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  61.62 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  38.4 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  29.7 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  32.99 
 
 
314 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  42.76 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  32.54 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  30.65 
 
 
259 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1019  protein of unknown function DUF1559  33.93 
 
 
768 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.526908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  53.85 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0392  protein of unknown function DUF1559  36.08 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  72.73 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  43.28 
 
 
219 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  39.05 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  37.05 
 
 
317 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.26 
 
 
140 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  45.45 
 
 
142 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0958  hypothetical protein  27.5 
 
 
742 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113701  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.94 
 
 
142 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  39.13 
 
 
131 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
150 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 
150 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 
158 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  40 
 
 
129 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4063  hypothetical protein  37.33 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  44.93 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  39.33 
 
 
252 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
154 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  36.73 
 
 
165 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36.25 
 
 
159 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  29.11 
 
 
140 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  41.54 
 
 
124 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>