55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0563 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  29.09 
 
 
326 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  42.65 
 
 
338 aa  52.4  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  52.08 
 
 
349 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  52 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  51.92 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  31.54 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  30.2 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  53.19 
 
 
313 aa  49.7  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.19 
 
 
168 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  52 
 
 
324 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  42.86 
 
 
348 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  48.94 
 
 
323 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  36.36 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  27.34 
 
 
321 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.27 
 
 
142 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  44.9 
 
 
362 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  41.67 
 
 
377 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  36.71 
 
 
130 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  39.34 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  31.91 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.68 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  35.19 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  40.35 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  35.19 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.48 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  39.34 
 
 
353 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.48 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.48 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.48 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.33 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  40 
 
 
141 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  32.14 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  35.44 
 
 
128 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  35.44 
 
 
124 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  35.44 
 
 
124 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  32.56 
 
 
124 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5446  putative type IV pilus biogenesis protein  43.86 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0279047  normal  0.0743907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  37.5 
 
 
128 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  27.08 
 
 
133 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  34.33 
 
 
140 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  32.91 
 
 
124 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  34.62 
 
 
129 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  36.51 
 
 
129 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  34.18 
 
 
124 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  44.44 
 
 
152 aa  42.4  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.03 
 
 
155 aa  42  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2674  hypothetical protein  30.53 
 
 
246 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.212259  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  40 
 
 
237 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  40 
 
 
237 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  46.81 
 
 
143 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  30 
 
 
161 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>