More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1385 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  46.72 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  43.08 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  43.84 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  44.44 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  35.17 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  34.62 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  70.21 
 
 		 191 aa  72  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  66.67 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  65.38 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  64.71 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  54.55 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  65.38 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  35.79 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  34.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  85.71 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  46.55 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  43.1 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  38.67 
 
 		 190 aa  62  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  34.91 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  55.56 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1323  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  53.85 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  53.85 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  54.55 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  27.45 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  38.98 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  31.62 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0781  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.070782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  35.35 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  29.7 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  45.16 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  37.65 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  40.91 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  78.57 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  37.1 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  42.59 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  32.95 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  33.33 
 
 		 212 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  28.3 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  40.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  38.81 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  37.68 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  21.62 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  33.72 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  41.82 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  58.97 
 
 		 195 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  42.31 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  37.88 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  46.15 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  46.15 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  46.15 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  48.94 
 
 		 167 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  46.15 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  36.84 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  36.84 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  33.65 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  40.28 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  35.79 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  40 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  39.66 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  43.75 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  34.18 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  28.71 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  41.07 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  50 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  30.84 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>