62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0028 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  100 
 
 		 162 aa  333  7e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  51.67 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  29.27 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  41.43 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  49.12 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  44.07 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  47.06 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  44.07 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  45.16 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  54.55 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  50.91 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  50.91 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  40.98 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  64.1 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  47.27 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  50 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  62.16 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  52.27 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  56.76 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  45.76 
 
 		 82 aa  48.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  44.68 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  46.67 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  45.65 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.93 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1481  hypothetical protein  37.68 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.742328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  48.72 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  29.32 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  31.67 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  35.56 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  51.35 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.03 
 
 		 151 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  32.22 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  41.46 
 
 		 169 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.69 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.2 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  44.12 
 
 		 67 aa  41.6  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.91 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.33 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.07 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  45 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.8 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.76 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  41.86 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  51.43 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  33.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.33 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.51 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  32.47 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>