266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0320 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  100 
 
 
141 aa  287  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  55.8 
 
 
137 aa  161  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  46.72 
 
 
133 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  44.62 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  35.66 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  36.36 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  43.75 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  53.7 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  66.67 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  24.31 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  52.94 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  69.05 
 
 
135 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  34 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  64.44 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  28.08 
 
 
210 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  55.81 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  41.77 
 
 
191 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  40.74 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  72.22 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  57.14 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  57.14 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  29.5 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  64.1 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  40.51 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  40.51 
 
 
191 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  46.55 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  42.25 
 
 
192 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  45.76 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  48.08 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  49.15 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  44.44 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  46.15 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  62.79 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  48.08 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  42.42 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  47.76 
 
 
197 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  43.08 
 
 
172 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  33.03 
 
 
231 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  50 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  40.32 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  62.16 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  44.12 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  44 
 
 
192 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  34.29 
 
 
172 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  38.16 
 
 
186 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  37.5 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  49.06 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  44.26 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  50 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  36.71 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  49.06 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  43.55 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  48.15 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  48.15 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  48.44 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  41.27 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  39.68 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  44.44 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  38.81 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.74 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  41.33 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  35.85 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  35.85 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  42.67 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  42.67 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  41.27 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  42.86 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  41.27 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  29.63 
 
 
232 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  44.64 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  42.19 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  33.57 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  41.94 
 
 
173 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  38.46 
 
 
229 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  40.62 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  57.89 
 
 
195 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
144 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  35.71 
 
 
163 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  37.97 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  44.07 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  31.51 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
149 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  41.54 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  41.54 
 
 
186 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  37.66 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  53.85 
 
 
211 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  39.68 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  35.38 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  35.9 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  43.4 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>