154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0866 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0865  N-terminal methylation domain-containing protein  38.1 
 
 
253 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  30.41 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  33.87 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  34.09 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  48.39 
 
 
67 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  49.02 
 
 
136 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  28.08 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  32.22 
 
 
145 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  42.03 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  46.55 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  30.3 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  33.66 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  39.66 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  43.1 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  49.15 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  39.66 
 
 
187 aa  52  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  34.78 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  37.68 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  52.27 
 
 
162 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  34.83 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  41.27 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  55.26 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  44 
 
 
178 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  55.26 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  55.26 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  46 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  31.76 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  46.94 
 
 
193 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  52.63 
 
 
171 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  36.23 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  28.04 
 
 
148 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36.9 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  36.23 
 
 
144 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  36.9 
 
 
156 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  28.04 
 
 
142 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  44 
 
 
186 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  30.23 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  57.14 
 
 
135 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  42 
 
 
187 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  42 
 
 
187 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  45.83 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
166 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  42 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
146 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  42 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  38.75 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  36.23 
 
 
148 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  39.34 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  40 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
147 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
147 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
144 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  33.73 
 
 
156 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
154 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 
143 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  40 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  33.82 
 
 
144 aa  45.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  25.86 
 
 
160 aa  45.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  40.32 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  28.24 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  44.19 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.17 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  32.98 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  35.48 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  29.89 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  25.61 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.9 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  39.39 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  32.08 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  36.23 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  31.48 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  32.08 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  35.85 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  46.34 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  31.48 
 
 
158 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  37.68 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  37.68 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>