51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1477 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  318  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  318  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  38.82 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  36.31 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  63.79 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  35.71 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  66.07 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  38.13 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  57.14 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  54.55 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  25.6 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1479  hypothetical protein  25.49 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.574499  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  53.85 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  68.42 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1480  transformation system protein  56.52 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.754405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  57.14 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  27.69 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  45.83 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  43.75 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  45.83 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  60.53 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  55.26 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  35.29 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  44.44 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  31.3 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.93 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 		 158 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  30.51 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  60.53 
 
 		 220 aa  42  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  30.23 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  33.9 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.9 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  58.62 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  34.48 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  34.48 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  57.58 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.58 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  31.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  32.76 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  27.54 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  31.03 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>