More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0366 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  49.25 
 
 		 187 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  44.32 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  46.15 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  35.05 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  35.79 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  52.08 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  35.79 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  43.66 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  45.31 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  45.31 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  45.31 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  45.31 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  42.42 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  42 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  47.06 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  42.25 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.94 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  40.54 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  42.25 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  42.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  43.28 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  43.33 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  58.49 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  40.28 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  43.28 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  43.28 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  57.89 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  47.83 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  52.17 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  62.5 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  50 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  44.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  67.65 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  60.42 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  62.79 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  38.24 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  39.53 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  51.11 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  42.37 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  57.89 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  64.71 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  41.79 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  41.3 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  61.76 
 
 		 193 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  55.26 
 
 		 192 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  37.1 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  41.3 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  45.1 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  50.98 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  55.26 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  45.1 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  40 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  43.33 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  40 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  43.48 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  52.83 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  30.66 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  64.71 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  43.14 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  43.14 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  38.71 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  62.16 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  51.06 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  43.14 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  43.14 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  36.14 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  40.26 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  67.57 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  26.21 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  62.5 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  45.83 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  36.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  50 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  38.57 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  40.26 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  62.5 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  43.4 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  38.46 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.3 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  38.96 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  46.81 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  46.77 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  44.68 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  72.41 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  41.3 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  41.3 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  50 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  52 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  57.14 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>