217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0864 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 
136 aa  270  5.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  33.33 
 
 
143 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  34.62 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  59.18 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  50.85 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  43.75 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  40 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  57.45 
 
 
191 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  55.1 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  55.1 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  49.02 
 
 
210 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  31.58 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  61.54 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  48.94 
 
 
190 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  50 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  50 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  51.06 
 
 
169 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  55.56 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  46.81 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  46.81 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  39.29 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  62.5 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.53 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.78 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  32.1 
 
 
156 aa  50.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  47.27 
 
 
187 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  47.27 
 
 
187 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  47.27 
 
 
187 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  35.96 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  47.27 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.14 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  60.53 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  60.53 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  44.44 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.85 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  33 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  45.45 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  44.62 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  48.15 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.87 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  47.62 
 
 
220 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  48.15 
 
 
192 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  48.15 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  40 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.77 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  41.82 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  31.06 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  41.82 
 
 
178 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  55.26 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.34 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  28.21 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  49.09 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  32.39 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.18 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.33 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.33 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  51.22 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.67 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  29.37 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  31.87 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.58 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  46.15 
 
 
187 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  30.15 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  29.06 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  39.58 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  42.59 
 
 
186 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.15 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.45 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  61.54 
 
 
232 aa  44.3  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  55.81 
 
 
193 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.43 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  42.86 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  25.48 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  39.62 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  29.11 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  33.63 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.29 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  37.31 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  38.75 
 
 
149 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  35.96 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  55 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  34.09 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  42.86 
 
 
231 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>