107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0536 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  275  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  45 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  37.76 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  69.23 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  41.24 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  47.37 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  44.64 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  39.44 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.34 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  26.77 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.03 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  32.73 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.41 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.07 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  36.36 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.23 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  39.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.31 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  30.85 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.28 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.53 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  39.68 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.07 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  41.18 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.07 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  24.52 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.83 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.48 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  44.68 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  36.07 
 
 		 323 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  37.25 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  39.22 
 
 		 325 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.23 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.8 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  32.1 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  48.65 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.38 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  28.71 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.62 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  35.29 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  37.25 
 
 		 330 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  39.22 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  39.29 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.14 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.7 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.39 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  35.85 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  37.25 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.22 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  38 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  48.72 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  37.25 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  52.78 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  31.37 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 151 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.04 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  47.06 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  37.25 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  42.86 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  40.74 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  26.36 
 
 		 153 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  52.78 
 
 		 173 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  39.22 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  38.78 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  32.69 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  39.62 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  32.69 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.28 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  48.72 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  31.96 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  38.78 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  29.81 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  29.81 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 		 338 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  31.82 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  35.29 
 
 		 348 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  38.89 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 		 362 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  38.18 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  34.55 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>