44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2373 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  46.45 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  41.82 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  36.36 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  27.08 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  33.75 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  33.54 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  26.56 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  30.35 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  26.56 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  26.42 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  27.08 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  27.46 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  27.46 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  27.46 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  23.88 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  28.97 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  27.59 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  27.59 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  24.86 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  28.81 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  26 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  27.01 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  27.01 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  28.57 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  26.18 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  26.09 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  24.43 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  24.43 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  25.75 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  24.68 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  21.51 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  20.79 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  40.3 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  33.03 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  45.16 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  25.26 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  43.94 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  25.38 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  43.28 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  43.94 
 
 		 162 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  31.18 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>