186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0619 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0619  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  259  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  43.64 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  36.36 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  32.22 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  32.22 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  31.82 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  35.38 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.05 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  34.52 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  30.61 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  46.51 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  34.69 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  38.3 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  35.96 
 
 
144 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  35.19 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  36.17 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  43.86 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  32.53 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  37.74 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.87 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.87 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  39.71 
 
 
252 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.95 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  27.52 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.62 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  37.04 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  25 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  29.47 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  35.85 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  29.85 
 
 
323 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  30.56 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  33.8 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  26.55 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  36.92 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  29.47 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.56 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2368  hypothetical protein  30.3 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  29.87 
 
 
338 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  29.03 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  35.19 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  29.03 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  28.42 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  27.66 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  31.68 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.91 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  39.62 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  28.09 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  30.85 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  35.29 
 
 
188 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  25.81 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  32.93 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  26.87 
 
 
326 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  30.56 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.4 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  28.92 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  30.23 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  30 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  38.46 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.77 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  31.58 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.51 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  28.42 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.61 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  32.2 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  25.66 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  40.82 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.76 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  34.78 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  30.56 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  32.84 
 
 
140 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  32.84 
 
 
140 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  31.86 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.11 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  31.25 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  32 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  32.14 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>