More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0957 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0957  Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 		 137 aa  276  7e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  54.05 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  44.44 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  35.71 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  51.56 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.25 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40.7 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  37.65 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  36.67 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  43.75 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.78 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  36.28 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  42.03 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  51.52 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  36.08 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  33.66 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  38.82 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  38.3 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  53.49 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  37.8 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  50 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  48 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.45 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.59 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.47 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  35.37 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  37.66 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.46 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  30.36 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  35.23 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  36.96 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  61.54 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  35.19 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  36.71 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  28.89 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  32.93 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.19 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  32.93 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0974  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  61.11 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  32.93 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.46 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  37.35 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.19 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  53.66 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.51 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  31.71 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.98 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  30.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  27.41 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  53.66 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  37 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  28.15 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  35.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  25.9 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  36.56 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  39.71 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  37.18 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  62.86 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  51.11 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  35.77 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  27.41 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  46.67 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  32.93 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  37.18 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  52.78 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  40.54 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  35.44 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  31.01 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.67 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  34.67 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  44 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  46.67 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  38.57 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  25.66 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  47.17 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  39.34 
 
 		 319 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  27.41 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.94 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.31 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  27 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  27 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  46.67 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  27 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  35.53 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  43.86 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  46.67 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  50.98 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  46.67 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>