78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0974 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0974  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0973  hypothetical protein  36.11 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  28.71 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  27.86 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  34.04 
 
 		 120 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  27.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  38.71 
 
 		 132 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  29.31 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  35.56 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  25.71 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  27.66 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  31.62 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  28.18 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1091  general secretion pathway protein H  34.72 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162254  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  29.85 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  27.86 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  26.35 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  27.14 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0718  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  27.86 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  26.35 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0717  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  26.76 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  28.69 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1047  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  36.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  28.19 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  27.66 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  29.81 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  25.18 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  27.72 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  27.39 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1050  general secretion pathway protein H  34.72 
 
 		 143 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 156 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  29.52 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  47.5 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  25.88 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  31.91 
 
 		 146 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  35.87 
 
 		 235 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  31.51 
 
 		 235 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  26.21 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  26.43 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  29.13 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  29.13 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  26.21 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  26.4 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  30.43 
 
 		 129 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.46 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  25.66 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  30.36 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  25.66 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  25.66 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0995  hypothetical protein  35.48 
 
 		 123 aa  41.2  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  29.52 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>