65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2274 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  84.29 
 
 		 140 aa  236  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  43.55 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  34.15 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  26.4 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  26.32 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  29.51 
 
 		 145 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  28.43 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  25 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  29.73 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  40.82 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  27.43 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  35.29 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  26.6 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  26.6 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  28.1 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  27.87 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  24.09 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  32.89 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  38.78 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  36.84 
 
 		 163 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  27.03 
 
 		 395 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  27.78 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  27.66 
 
 		 128 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  38.46 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  35.29 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  29.85 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  30.77 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  23.7 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  27.78 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  26.42 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  32.73 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  29.9 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  29.81 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  35.09 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  27.96 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  31.15 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  31.18 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  25.58 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  35.09 
 
 		 192 aa  40  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  44.44 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  29.49 
 
 		 197 aa  40  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  40  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  43.59 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  23.77 
 
 		 156 aa  40  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  33.82 
 
 		 186 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3049  hypothetical protein  32.39 
 
 		 135 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  30.36 
 
 		 150 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  29.58 
 
 		 166 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>