105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2572 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  100 
 
 		 140 aa  276  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  84.29 
 
 		 140 aa  236  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  28.8 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  25.47 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  40.74 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  26.23 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  34.38 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  32.76 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  31.13 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  31.58 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  48.98 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 148 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  29.25 
 
 		 185 aa  43.9  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.67 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  34.15 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  34.15 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  32.93 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  24.79 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.88 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  31.08 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 144 aa  42  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  29.58 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  30.3 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  33.85 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 146 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  36.71 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  43.48 
 
 		 319 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  31.03 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  30.51 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  31.11 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0863  putative secretory pathway protein  30.77 
 
 		 395 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00022206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2560  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  48.65 
 
 		 170 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  37.25 
 
 		 129 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  41.51 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  22.83 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  33.8 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  33.8 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  36.51 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  33.8 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  45.71 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  33.8 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  24.3 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  28.95 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.31 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  32.81 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  35.48 
 
 		 175 aa  40.8  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  26.47 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  30 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.24 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  28.95 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  26.27 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  37.25 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  27.69 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  32.26 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  27.69 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  36.36 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  30.36 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  42.62 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  34.43 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.19 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  34.43 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3049  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.76 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>