239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1300 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  8.000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.55 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.71 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  29.94 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.75 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.03 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.79 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.56 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.79 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.68 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.95 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  26.57 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.37 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.16 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.56 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.48 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.41 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.93 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 
175 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  40.51 
 
 
79 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.96 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.28 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  41.77 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.27 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.81 
 
 
167 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.79 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.19 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  38.27 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.98 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  39.24 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  31.58 
 
 
148 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.73 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  30.86 
 
 
176 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  35 
 
 
527 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  35 
 
 
567 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.12 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.28 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.05 
 
 
193 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  26.53 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.17 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  45.16 
 
 
182 aa  50.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  40 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.83 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  40 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  44 
 
 
634 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.84 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.16 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.5 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  44.83 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  27.95 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  30.77 
 
 
548 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  38.67 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  35.8 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  28.57 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  32.58 
 
 
136 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  35 
 
 
155 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  36.9 
 
 
149 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  43.86 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  48.84 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  51.28 
 
 
169 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  65.62 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  26.17 
 
 
158 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  36.05 
 
 
149 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  54.55 
 
 
136 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  27.71 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  44.19 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  36.11 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  30.33 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  30.33 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.94 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  36.11 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  29.75 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.84 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  35.82 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  32.86 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.87 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  44.23 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  52.5 
 
 
48 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  60.61 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  42.11 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  36.62 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  38.89 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  55.26 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  34.72 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  45.45 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  50 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.44 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  33.8 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.14 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.14 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  58.33 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.86 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>