49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4116 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  41.95 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1594  hypothetical protein  39.17 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  30.48 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  37.97 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  33.33 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  42.19 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  42.19 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35.19 
 
 		 162 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  23.53 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1863  hypothetical protein  24.08 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  36.21 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  25.28 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  36.67 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 145 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  34.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  33.93 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  37.7 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  36.84 
 
 		 111 aa  45.1  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  33.33 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  36.21 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  36.21 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  34.55 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  32.76 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.76 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  27.69 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  32.14 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  22.92 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  28.81 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  30.11 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.11 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  31.58 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  32.26 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.41 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  34.55 
 
 		 175 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  52.78 
 
 		 149 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  48.89 
 
 		 149 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  50 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  45.24 
 
 		 148 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  23.93 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  44.68 
 
 		 138 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  51.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  47.06 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  39.47 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  35.09 
 
 		 132 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  57.14 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.5 
 
 		 141 aa  41.2  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>