48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1863 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1863  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  27.13 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  24.08 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  25.32 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  28.28 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.65 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  29.84 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  25.16 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  29.31 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  39.62 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  22.52 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  27.54 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  31.08 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  29.32 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.73 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  29.41 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  32.86 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  41.3 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  33.82 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5159  type 4 prepilin-like protein  24.1 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.259971  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  28.38 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  29.63 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  31.34 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.41 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  28.38 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  23.88 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  32.84 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  22.39 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  22.44 
 
 		 162 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  37.21 
 
 		 147 aa  42  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  41.3 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 141 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06981  hypothetical protein  23.08 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  31.34 
 
 		 145 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  28.38 
 
 		 167 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  26.5 
 
 		 149 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.73 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  26.36 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  36.92 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  32.76 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>