37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06981 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_06981  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1196  hypothetical protein  51.28 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00498598  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  34.43 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  33.33 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.89 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  28.7 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  28.99 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.56 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  31.25 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  23.97 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  28.99 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  27.78 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  28.17 
 
 		 146 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 146 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 146 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  24.64 
 
 		 168 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  20.96 
 
 		 188 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  28.17 
 
 		 146 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 144 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 144 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  26 
 
 		 111 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  24.44 
 
 		 134 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  29.63 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  26.39 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 145 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  33.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  31.37 
 
 		 114 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  29.33 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>