54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0271 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  387  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1594  hypothetical protein  71.82 
 
 		 130 aa  157  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  41.95 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  30.62 
 
 		 225 aa  95.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  27.27 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1863  hypothetical protein  27.13 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  43.94 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  20.37 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  20.37 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  37.88 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  22.42 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5159  type 4 prepilin-like protein  22.95 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.259971  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  33.33 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  27.88 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  33.82 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  30.51 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  34.33 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  33.82 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  36.54 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  31.87 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  35.19 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.49 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  31.46 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  34.33 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  28.57 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.92 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  23.67 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  34.33 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  32.35 
 
 		 144 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  33.93 
 
 		 145 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  31.11 
 
 		 146 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.03 
 
 		 141 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.74 
 
 		 152 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  29.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  30.36 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  30.88 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  32.95 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.11 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  24.68 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  24.66 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  38 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  30.34 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.17 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  29 
 
 		 195 aa  40.8  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  62.96 
 
 		 146 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  29.59 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>