28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1736 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  98.25 
 
 
171 aa  338  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  37.04 
 
 
172 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  34.13 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5159  type 4 prepilin-like protein  29.75 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.259971  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  30.41 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0372  type 4 prepilin-like protein  35.9 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  25.86 
 
 
215 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2590  pilin-like protein-like  29.03 
 
 
171 aa  52  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.545428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  20.37 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  30.1 
 
 
161 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  30.56 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  33.33 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  24.03 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  31.94 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  27.78 
 
 
163 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  30.53 
 
 
225 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  28.09 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  25.93 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.67 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  23.9 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.57 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  21.23 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  40.54 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  40.54 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  30.17 
 
 
131 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  30.17 
 
 
131 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  25.74 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.143316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>