52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0319 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  31.13 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  33.05 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  35.8 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  31.31 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  29.84 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  33.78 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  41.38 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  40.79 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  38.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  26.67 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  25.78 
 
 		 168 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  40 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.36 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  37.93 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  30.93 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  38 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.43 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  32.56 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  59.46 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  40.38 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  35.19 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  48 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.14 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  34.62 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  34.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  50 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.05 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  33.75 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  41.3 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.78 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  44.23 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  37.04 
 
 		 111 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  41.54 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 		 150 aa  42  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  32.05 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.48 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  32.5 
 
 		 144 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35.71 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  44.44 
 
 		 133 aa  41.2  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>