84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0884 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0884  N-terminal methylation site  100 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0560375  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  40.38 
 
 		 155 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  37.13 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  36.25 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  31.41 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  34.16 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  29.78 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  43.42 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  30.77 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  32.37 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  30.43 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  28.85 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  25.81 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  31.21 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  31.25 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  33.58 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  28.95 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  28.95 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  30.36 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  28.95 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2669  hypothetical protein  44.93 
 
 		 567 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  30.56 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  28.85 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  29.87 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.33 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  39.34 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  28.74 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  28.48 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  29.8 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  25.16 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  27.27 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  34.21 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  33.08 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  34.62 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  28.75 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.2 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  37.33 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  30.66 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  52.78 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  37.33 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  37.33 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  37.29 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  25.58 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3429  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  28.39 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  25.68 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  43.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2000  hypothetical protein  31.52 
 
 		 222 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  28.26 
 
 		 133 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  44 
 
 		 108 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  50 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  28.75 
 
 		 156 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  56.67 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  41.18 
 
 		 232 aa  42  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  28.28 
 
 		 144 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  30.3 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  30.59 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  30.77 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  30.84 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  42.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  64 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  42.31 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  34 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  40.74 
 
 		 202 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  41.07 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.82 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  41.82 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  42.86 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  27.74 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 158 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0761  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  26.52 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0298843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  53.33 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  36.36 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  35.29 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>