180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0462 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  58.44 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  54.9 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  53.59 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  53.59 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  51.3 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  51.95 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  55.84 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  50 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  50 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  50.32 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  50 
 
 		 154 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  49.69 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  53.59 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  43.83 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  45.22 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  34.86 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  35.8 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  31.58 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  30.97 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  32.05 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  29.73 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  29.73 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  29.73 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  29.73 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  26.55 
 
 		 204 aa  51.2  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  38.33 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  41.82 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  42.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  49.12 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  57.58 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  37.88 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  63.89 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  61.11 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  63.89 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  63.89 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  67.65 
 
 		 191 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  67.65 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  40.62 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  64.71 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  68.57 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  46 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  64.71 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  37.29 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  46.43 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  40.38 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  42 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  30 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  30 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  42 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  36.84 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  46.94 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.06 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  37.88 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  62.07 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  28.86 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  29.32 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  33.02 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  38.6 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  61.29 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  42.22 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  31.11 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  25.62 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  38.98 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  63.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  32.47 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  33.82 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  36.84 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  42.55 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  46.94 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  38.78 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  46.94 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  41.18 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  28.89 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.24 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  33.82 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  58.06 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  51.28 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  26.06 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  46.94 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  55.56 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  32.84 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  55.56 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  36.71 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  47.06 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  60.61 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.81 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  60.61 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.81 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  60.61 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.81 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  57.14 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  42.55 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  60.71 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>